Nie każdy pacjent z koronawirusem jest równie zaraźliwy. Ważną rolę odgrywa tutaj stężenie wirusa – wskazuje na to wartość Ct. Ale co oznaczają różne liczby?
Testowanie reakcji łańcuchowej polimerazy (PCR) jest standardową procedurą w pandemii COVID-19. W całym kraju ludzie są o tym ostrzegani Korona wirus został przetestowany. Ogromna zaleta testu: jest bardzo czuły. Oznacza to, że jeśli próbka zostanie pobrana prawidłowo, może wykryć prawie każdego zarażonego.
Ale jednocześnie wysoka czułość może również oznaczać, że test wykaże pozytywny wynik, chociaż infekcja koroną jest tak zaawansowana, że w organizmie zarażonej osoby prawie nie ma wirusów. Ponieważ test PCR wykrywa nie tylko żywe cząsteczki wirusa, ale także wirusowe RNA (materiał genetyczny). A jeśli stężenie wirusa jest niskie, ryzyko infekcji również jest niskie. Krótko mówiąc: każdy, kto uzyskał pozytywny wynik testu na koronę, niekoniecznie jest zaraźliwy.
Eksperci są jak wirusolog Christian Drosten Już w 2020 roku proponowano wykorzystanie specyficznej właściwości testu PCR do oceny stopnia zakażenia osoby zakażonej: wartości Ct. Ale procedura jest nadal odpowiednia tylko w ograniczonym zakresie.
Jak działają testy reakcji łańcuchowej polimerazy:
Metoda reakcji łańcuchowej polimerazy wykorzystuje jako podstawę materiał genetyczny wirusa, RNA. W tym celu od osoby badanej pobierany jest materiał genetyczny, który zwykle uzyskuje się z wymazu z jamy ustnej, nosa lub gardła. Jeśli ktoś jest zarażony SARS-CoV-2, próbka zawiera materiał genetyczny wirusa. Te cząsteczki RNA są izolowane w procesie chemicznym i amplifikowane za pomocą tak zwanej reakcji łańcuchowej polimerazy.
Co oznacza wartość Ct?
Wartość Ct („próg cyklu”) może wskazywać, ile wirusa nosi pacjent. Jest on zbierany przez laboratorium i pokazuje, ile okrążeń należy wykonać metodą reakcji łańcuchowej polimerazy (PCR), zanim wirus zostanie wykryty. Im mniej jest wirusów, tym więcej cykli jest potrzebnych do wzbogacenia genomu tak, aby był odpowiedni do wykrywania wirusów.
- Jeśli wartość Ct jest niska, oznacza to, że w próbce występuje wysokie miano wirusa.
- Jeśli wartość Ct jest wysoka, oznacza to, że stężenie wirusa w badanej próbce jest zwykle niższe.
Zasadniczo wartość Ct można wykorzystać do określenia, jak duże jest obciążenie koronawirusem w gardle lub nosie osoby. Według lekarzy laboratoryjnych wartości Ct powyżej 30 wskazują na niskie stężenie wirusa, podczas gdy wartości Ct powyżej 35 wskazują na bardzo niskie stężenie wirusa. Zgodnie z tymi wartościami jest bardzo prawdopodobne, że pacjent nie jest już zakaźny. Według Instytutu Roberta Kocha (RKI), żaden wirus nie może zostać odtworzony w badaniach laboratoryjnych z próbek o wartości Ct większej niż 30.
Wartości Ct nie są brane pod uwagę
Wartość Ct jest mierzona w każdym teście PCR, ale rzadko jest raportowana do Departamentu Zdrowia. Oznacza to, że tylko w pojedynczych przypadkach władze znają wyniki laboratoryjne, w jakim stopniu osoba, która uzyskała wynik pozytywny, została zarażona.
Instytut Roberta Kocha zaleca stosowanie wartości Ct do oceny tylko w jednym przypadku: jeśli osoba chora ukończy zaleconą izolację, szybki test daje wynik negatywny, ale test PCR jest pozytywny z wartością Ct znacznie powyżej 30, tak robi Departament Zdrowia. Nie zamawiaj więcej izolacji. Wynik wskazuje, że infekcja ustąpiła, a pacjent jest klasyfikowany jako wyzdrowiał pomimo pozytywnego wyniku testu.
Jak istotna jest wartość Ct?
Jednak coraz więcej głosów wskazuje, że wartość Ct ma tylko ograniczone znaczenie, ponieważ wysoka wartość Ct nie zawsze oznacza, że pacjent ma niską wiremię w gardle. Zmierzone stężenie wirusa zależy głównie od techniki użytej do pobierania próbek. Na przykład istnieje różnica między wymazem z gardła a wymazem z nosa i gardła. Ważne będzie również, aby zawsze pobierać taką samą ilość wymazów od pacjentów.
Nawet laboratoria medyczne ostrzegają o poziomach Ct, gdy Test PCR za błędną interpretację. Laboratorium MVZ w Ravensburgu pisze w liście do klinicystów, że oprócz „suboptymalnego pobierania próbek”, zmniejszoną lub osłabioną infekcję można również uznać za przyczynę podwyższonych wartości Ct. W końcu, nawet u ciężko chorych pacjentów, wirus może już przemieszczać się z okolic gardła do płuc, co jest przyczyną niskiego stężenia wirusa. Oznacza to, że ważny jest czas testu.
Kolejny punkt, który ogranicza ważność wartości Ct: istnieją testy PCR od różnych producentów, które niekoniecznie dają te same wyniki testu. Standaryzacja testów PCR wciąż trwa. Według RKI istnieją obecnie próbki referencyjne, które zapewniają lepszą porównywalność.
Pozostaje tylko to, że wartość Ct jest jedynie wartością orientacyjną dla ryzyka infekcji, ponieważ testy PCR nie są wystandaryzowane, a wyniki zależą od pobierania próbek.